
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱海洋生物 为其提供 TMT核蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
调查最终结果
研究探讨的人员与探讨跟随要在要在冷藏室保存室保存日子变长羊肉的强度、持水力发电、质地、徘徊铁水分分子量、ROS、脂质过氧化反应物、MDA、GSH和GPX4横向来考评腹肌策划 癌细胞膜的铁自杀环境。最后显示信息,要在要在冷藏室保存室保存日子变长后,羊肉的强度在第四天和第6天相关性越来越低;持水特性影响;本色变深,丢失质感,鲜大网红换成暗大网红。显然,徘徊铁、灵活性氧和MDA的水分分子量相关性加剧,癌细胞膜凋亡率相关性提高。 实验工作员取出不同冷冻日子的胸肌合格品的血清质,然后呢开展SDS-PAGE剖析,血清质条带在不同晚清时期分布图匀且似的(图1a)。基于血清在不同合格品中的表达出情况发生,剖析察觉到同时间组合格品的中十位数比较接近于于同时间层次(图1b),阐述胸肌合格品血清质具不错的组内似的性和组间不同性。 脂肪酸酶质组学共检测结论出1996种脂肪酸酶质。以B0为对比组,挑选B1、B2、B4和B6中的脂肪酸酶开展一定的异同描述出定性分折,共检测结论到375个DEPs。将火山图可视化效果,并按照其FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.053个规则定性分折DEP。报告单提示1c-f提示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别检测结论出22、33、73和140个DEPs,中仅别调整6、11、32和8八个,再降16、22、41和58个。聚类分析技巧估评了不一样的保鲜步骤脂肪组建中脂肪酸酶质的描述出,报告单显视脂肪脂肪酸酶描述出一定的异同现在处理时刻的上升而上升(图1g)。
图1| 各种不同保鲜时段的肌样品管理高蛋白质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 多种冷藏箱的时间的身体肌肉样板不同之处球蛋白分折(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁窒息死亡淀粉酶肽的PRM降钙素原检测进行分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 针对KEGG生物富集相互影响呈现蛋白质的铁消亡管理机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物制品提供了TMT降钙素原检测淀粉酶质组学科技服務,拜谱生物制品已生产制造结束并建造了改进成熟完善的转录组学、淀粉酶组学、细胞代谢组学或者几组学协同物料科技服務标准体系,欢迎致电咨询!
符合期刊论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.