代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
基本有效有效有效成分能力鉴定会费：消化吸收组学能力是行对中成药才中的物理基本有效有效有效成分做好率先探讨，能力鉴定会费出中成药中的普通机械活化基本有效有效有效成分。举例子，灵活运用系统设计质谱（MS）的消化吸收组学能力，行能力鉴定会费出西洋参中的西洋参皂苷等普通机械活化基本有效有效有效成分。这一能力还行分入药价值和非入药价值部位的物理标志物，为中成药才的质理操作能提供法律依据。
高效果调控：完成基础排泄率组学工艺，是能能对中葯的高效果完成评估报告格式和调控。譬如，采用草本花卉基础排泄率组学深入分析，是能能发掘而对类骨质增生性依然能炎的中葯组分的高效果记号的参考值的方法。虽然，基础排泄率组学还是能能辨识中葯中的渗透性组分以及渗透性体系，如完成UPLC-Q-TOF-MS实验，判断各种乌头草本花卉的催化组分，并辨识含有止痛抗逆性和亚急性渗透性的海洋生物碱。
2. 中药药效机制研究
目的靶点甄别系统：代谢率组学的技术能能好处甄别系统中西药吸附性成份的分子结构靶点。举个例子，钻研挖掘雷公藤红素可完成调控Treg/TH1和Treg/Th17平衡性、阻绝NF-κB信号通路等新机制起到抗感染目的。
使用原则阐述：分解组学新技术可能表明西药缓解传染性疾病的使用原则。比如，调查发现了青蒿素抗药性与疟原虫的线粒体分解调整有关，非靶向治疗分解组学表明了与该时候有关系的分解物转化。虽然，分解组学还可能能够 阐述分解物的转化，调查西药复方的使用原则。
3. 中药安全性评价
致毒逻辑学习：分解组学技术工艺是可以采用学习中草药的致毒逻辑。诸如，根据分解组学和16S rDNA测序的优势互补定量分析，具体分析了清益汤对危重症慢性胰腺炎关联慢性肺磨损的保养逻辑，并明确了铁沉稳、的差异分解物和微海洋生物菌群之前的内在联系。
防护性鉴定：细胞代谢组学科技还都可以适用中成药的防护性鉴定，辨别暗藏的致癌性材料和致癌性靶点，而为中成药的防护施用打造专业按照。
4. 中医证候研究
证候对应基础新陈排泄物探讨：基础新陈排泄组学技术水平还可以用到表现与老中医师证候对应的内源性基础新陈排泄物波动，辅助工具老中医师证候的初步判断和调查。随后，经过基础新陈排泄组学研究探讨，已在冠烦扰之处女性中签定出与痰瘀证和气流阴两虚证对应的生物工程标识物。
证候应对的探析：细胞产生组学方法还可用来的探析中药方对中醫证候的应对功效。举例子，利用细胞产生组学方法及聚类深入分析法深入分析法，表明“黄芪-茯苓-泽泻”等相关药材选择装配不适用来肾病标准化评估征的新组方药材，才可以对四种肾病标准化评估征相关的生物制品标示物产生关系。
5. 多组学技术整合应用
两组学整和：分泌组学与另外组学技术性（如染色体组学、转录组学、血清质组学等）的整和使用，为中医配方研究探讨展示 一个多层次的浅析架构图。一些整和使用实际上显现了我对中医配方组成在原子核表层上对人们内分泌系统和病症情况的功用，特别为阐述中医配方的功用制度和疗效元素基础条件展示 了强强而有力的软件。
肠道慢性病调理方法共识系统：多个学能力需要适用探析中药配方调理方法肠道慢性病的团伙共识系统。比如说，凭借蛋白质酶质组学和产生组学的合作应用，表明了与医学的分类的膝膝盖骨性膝盖炎密切合作关联的一定的差异描述蛋白质酶和产生通道。
代谢转化组学技能在中草药的研究中的用，为中草药的现化化和优质医疗管理带来了比较重要的科学学支持系统，促进企业带动中草药的原则化和全国化發展。