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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核生物体工程mRNA中偏重点的转录后装饰,在真核生物体工程的方面的问题和顺利历程中起着至关重点的反应。心脏病的了解性障碍不是种不可逆转的周围神经中枢周围神经整体退行性妇科疾病,现阶段发展壮大真的切系统并未完完全全展现,从而较弱行之有效的預防和疗法策略。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱动物为其提供m6A甲基化研究方法提供服务,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

好文章公司名称:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

老客户企事业单位:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

学习素材:小鼠脑组织

拜谱提高枝术:m6A甲基化(MeRIP-seq)

内容提要图:

图1| 内容提要图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

深入分析结果显示

1.DCI小鼠海马中m6Adna表达的提升

科研工人一开始实现了高脂餐饮和自我认同阻碍(DCI)的小鼠模式化。为对比参考组(n = 3)和DCI组(n = 3)直接的m6A什么是dna遗传表达,科研工人操作MeRIP-seq做了转录组超范围内的m6A-seq定量分析。在DCI组的10664个项目编码什么是dna遗传转录物(mRNAs)一共感觉参考组的2371一不叠加的m6A峰。相比较下面,DCI组体现出23,75一非叠加m6A峰。这里面,9343个甲基化什么是dna遗传在参考组和DCI组直接叠加(图2)。

图2| 比对组和DCl组m6a修饰语DNA的维恩图

共鉴别出12715个地域差异甲基化的m6A位点(DMMSs),在其中60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化情况下分别是特殊过于比较组。讲解其区情况下挖掘m6A峰区在整个的RNA中(图3A),并给出其区的转录区可分为低于五组:5'UTR、3'UTR、转录开始和结束位点区情节、停止账号密码忘了锁子情节、开始和结束账号密码忘了锁子情节和商品编号编码序列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和停止账号密码忘了锁子随近特殊生物富集(图3B)。要分析评价这遗传dna上m6A突显的区,理论研究员选择了有峰注音的区,并判断了这遗传dna上reads的所覆盖面积。在DCI组中,m6A突显区看重于3'UTR区(图3C)。大多数mRNA内的DMMS都被导航定位到上色体上来分析评价其区情况。各不相同小鼠上色体的m6A突显谱各不相同。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的影响

为了能产品检验m6A体现在DCI小鼠中的生物体体学技能,科学研究工人从2组选取择含带DMMS的核营养物质识别码dna来GO和KEGG讲解(图4A)。在GO讲解中,高甲基化dna在肿瘤受损细胞核系的过程中 中 中 中 、生物体体的过程中 中 中 中 调整、崔化活力氧和杂环化学物质构建中明显生物丰度。KEGG径路讲解展现,高甲基化dna与T肿瘤受损细胞核系蛋白激酶电磁波径路、小肿瘤受损细胞核系癌症和RIG-I样蛋白激酶电磁波径路微信关联(图4B)。就低甲基化dna,GO讲解展现在肿瘤受损细胞核系的过程中 中 中 中 、分泌的过程中 中 中 中 和构建的过程中 中 中 中 中明显生物丰度可挥发环化学物质、构建杂环化学物质和崔化活力氧(图4C)。KEGG径路讲解体现了了低甲基化dna与肥厚性心肌病和Hippo电磁波径路的微信关联(图4D)。

图4| 性别差异甲基化m6A位点的信号通路含有

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据文件的联合技术研究分析

然后研究方案师将m6A MeRIP-Seq的大动态数据和原先RNA-Seq的大动态数据实行连合概述,发现了163个mRNA,m6A峰和mRNA平行显著性调整。41种mRNA的m6A和mRNA平行上浮,14种mRNA平行调整。虽然,30个人类dnamRNA抒发方法上浮,m6A平行调整,74个人类dnamRNA抒发方法调整,m6A平行上浮(图5A)。最终,建设方案好几个个PPI在线来屏幕上显示163个人类dna商品编码的核蛋白相互间的连接方式(图5B)。

如图如图所示6如图所示,GO和KEGG具体讲解构成四组:(1) m6A上浮,mRNA变动;(2) m6A上浮,mRNA上浮;(3) m6A变动,mRNA变动;(4) 染色体m6A变动和mRNA上浮。在GO具体讲解中,m6A上浮和mRNA变动的染色体在体组织组织分泌转化转化操作具体步骤、香气族硫化反应物菌物自动合成操作具体步骤和RNA组织分泌转化转化操作具体步骤的调节管控中有效含有。KEGG具体讲解屏幕上出现,这样的染色体在核蛋白质堆积酸组织分泌转化转化、小体组织肺肿瘤、丙酸组织分泌转化转化和甲苯酸组织分泌转化转化中含有。针对于m6A上浮和mRNA上浮的染色体,GO具体讲解屏幕上出现在亚铁综合、亚胺丙氨酸脱羧酶几丁质酶、天冬氨酸1-脱羧酶几丁质酶和体组织接入装设负调节管控中含有;KEGG具体讲解屏幕上出现在2型尿毒症、核蛋白质堆积体组织要素讯号通道和胰岛素讯号通道中含有。在GO具体讲解中,m6A变动和mRNA变动的染色体在寡肽综合、谷胱甘肽综合和二硫硫化反应物硫化反应完美重现酶几丁质酶中含有,而在KEGG具体讲解中,同旁内角在檸檬酸不断循环往复(TCA不断循环往复)、丙酸组织分泌转化转化和多植物物种凋亡中含有。在GO具体讲解中,m6A变动和mRNA上浮的染色体在胚胎骨骨关节社会形态会发生、核蛋白激酶几丁质酶激发和NADP组织分泌转化转化操作具体步骤中含有,在KEGG具体讲解中,m6A变动和mRNA上浮染色体在新霉素、卡那霉素和神经系统养分要素讯号通道中含有。

图5| m6A甲基化与mRNA表答的协同研究

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG定量分析

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本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱生物制品提供了m6A甲基化系统服务的,拜谱生物工程可提供完善成熟的核蛋白组学、细胞代谢组学、转录组学以其两组学携手產品科技贴心服务,欢迎致电咨询!

符合资料:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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