
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原丰度MHC及综合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫检测肽队列包括译文资料后修饰语资讯,提高基因测序的真实度,并采用De novo从后测序方法,不依赖现有数据库,更高些通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰富多彩的数据资料研究东西为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递癌症抗原的行业
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01 措施科研
稿件题目大全:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
发稿期刊杂志:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)是种核转换蛋清,在肠癌中习惯性过理解,做以为淋巴肿瘤发生的的驱动器环境因素。近几年,靶点XPO1的小氧分子正被充当临床医学防癌口服药。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫系统肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 另一种来于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 肺部肿瘤-免疫细胞控制
本文主题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
投稿杂志社:Nature Communications IF:16.6 2023
恶意胸膜间皮瘤(MPM)都是种较果不健康的侵入性癌症复发。由现存的手术开展方法措施较弱较果,因迫切是需要是需要新的手术开展方法策略性。综上所述其T神经细胞侵润性,小说拜谱生物假说MPM都是个适用的手术开展方法性癌症复发预防针的阶段目标。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用应用于质谱的免疫检测肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶变胸膜间皮瘤抗体肽组学加测
03 日常细菌mRNA预苗研发
小文章题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
发稿期刊:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过立于质谱的免疫抗体肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌传染的Hela血肿瘤细胞和HCT-116血肿瘤细胞中鉴定结论MHC I呈递的抗原肽。
拜谱个人总结
天然免役检测抗体肽组学是球球蛋白质含量组学的有一个便捷发展进步的结点,它用心于研究探讨天然免役检测抗体设计中由重点结构性相匹配性分手后复合体(MHC)或人类白細胞抗原(HLA)团伙呈递的天然免役检测抗体肽。以上天然免役检测抗体肽是細胞外表呈递的肽段,就可以被T細胞快速精确,所以开启天然免役检测抗体想法。通过质谱的天然免役检测抗体肽组学都已经为签别MHC球球蛋白呈递肽的金标准化方法步骤,就可以真接签别多种生理性和病理学情况下多种结构性和細胞品类中的天然免役检测抗体肽组,譬如实物瘤或病毒有哪些传染的細胞。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋白质组学、代谢率组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的天然免疫肽组检则的服务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,可以为准且同时打造免役肽编码序列,发展多非举例免役肽,逐一筛分出正规新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
关联性文献综述
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y