其实有很多调查一起探讨了能开干体细胞（PSC）在正常值提升环境下保持稳定自我价值的更新和能开性的大分子机理，但PSC怎样在应激反应反应环境下孤岛活的机理在很多水平方向上还没有能够得到解决方法。转录后/译文资料调节作用对PSC至关更重要，但出门在外源性和在于应激反应反应环境下，PSC怎样在译文资料水平方向上协调机制和稳定其孤岛活和分裂尚不清晰。

2025年2月23日云南专科大学王英杰教练管理团队等在Stem Cell Research & Therapy自媒体（7.1）上发表“OCT4 translationally promotes AKT signaling as an RNA-binding protein in stressed pluripotent stem cells”的文章，文章发现在低氧应激条件下，转录因子OCT4可以作为RNA结合蛋白在转录后水平激活AKT信号通路，维持多能干细胞的存活和多能性。研究团队通过HITS-CLIP等组学分析技术，发现OCT4蛋白能与一系列靶mRNA结合。在应激条件下，OCT4蛋白可脱离DNA结合模式，转而结合到AKT通路相关基因（如AKT1）mRNA的5'UTR区域，发挥RBP和ITAF的功能。进一步利用翻译组测序（RNC-seq）和蛋白质组学分析证实，这种结合显著提升了靶mRNA的翻译效率，导致AKT通路蛋白的快速翻译，促进细胞存活。拜谱怪物为该钻研供应了球蛋白互作组加测服务管理，助力揭示OCT4的互作蛋白。该好的文章通信作著王英杰老师老师为拜谱生物工程体首席总裁完美培训顾问，拜谱生物工程体总副总呼建文共同摘要公布。

英文音标标题格式：OCT4 translationally promotes AKT signaling as an RNA-binding protein in stressed pluripotent stem cells, Stem Cell Research & Therapy, IF 7.1, 2025

笔者标准：浙江大学

科研建材：人类胚胎干细胞系H1和H9、NCCIT细胞

组学系统：转录组、蛋白酶互作组

PART.1

分析结论

OCT在转录后质量系统激活AKT1球蛋白理解

经由RNA影响敲低OCT4，感觉AKT1 mRNA品质偏态身高，而淀粉酶质品质变动往往并不大。这是因为OCT4在AKT1形容宏观调控中会出现转录后/翻意品质的不同之处。OCT4对于的一种大大多隶属于神经内部膜核结构潜在挥功用的转录指数，而大大多转录后/翻意的过程 进行在神经内部膜核质中，笔者经由亚神经内部膜核区分拿到胞质、神经内部膜核结构混合物，感觉神经内部膜核质中的OCT约占总淀粉酶的10%。

经由热塑天然免疫析出测序技木（HITS-CLIP）描绘出OCT4-RNA互作组

由以往的深入讲解讲解意味着OCT4应该是RBP，故而深入讲解讲解考生决定了操作HITS-CLIP技术水平平台性地解析视频OCT4-RNA能够 目的组。深入讲解讲解考生操作CRISPR/Cas9平台性共建了TAP-OCT4 H1受损组织细胞系，该受损组织细胞系在OCT4的5’UTR后敲入没事个TAP标鉴，以便于更非常容易地转移和丰度OCT4-RNA联系在一起起来物。经由这一手段，深入讲解讲解考生快速精确了不少OCT4联系在一起起来位点，这种位点范围在5’UTR、CDS、3’UTR、里面子、非标识号遗传基因遗传外显子、遗传基因遗传间范围和反义CLIP-seq标鉴中（图1）。操作MEME系统软件对OCT4联系在一起起来位点实现motif讲解，挖掘GC-rich的(5′-GCCG-3′)编码序列在OCT4联系在一起起来位点中更为明显丰度，特别的是坐落在翻泽初始位点的GC-rich六聚体（图1）。

图1 OTC4运用靶dnamRNA的5’-UTR区

（原自：Chen, et al., Stem Cell Research & Therapy, 2025）

利用OCT4整合PI3K/AKT径路dna的mRNA

生态学资讯学研究现示OCT4紧密依照的染色体遗传其主要经由RNA消化吸收、译文资料、各类促进和各种压力反應等生态学学过程中 中，这取决于OCT4在这过程中 中中应该更好地发挥关键性的调结管控能力。这染色体遗传的模块也之中主要还有蛋清质磷硝化能力、内源性凋亡电磁波通道和干受损神经癌癌组织細胞保证等。GO研究取决于，OCT4紧密依照的染色体遗传生长在受损神经癌癌组织細胞的大位置地区，也之中主要还有受损神经癌癌组织細胞质、受损神经癌癌组织細胞质和受损神经癌癌组织細胞结构。GO碳原子模块研究取决于，OCT4紧密依照的染色体遗传兼备DNA紧密依照、RNA紧密依照和激酶紧密依照等模块。KEGG通道研究将OCT4紧密依照的染色体遗传聚类分析法到多少通道中，之中也之中主要还有受损神经癌癌组织細胞吸咐、PI3K/Akt电磁波通道和PPAR电磁波通道。与AKT调结管控能力相同，OCT4紧密依照到2个PI3K/AKT电磁波通道染色体遗传的mRNA，也之中主要还有PIK3CD、PIK3R2、PDPK1、AKT1、KRAS、BAD和EIF4E。这取决于OCT4应该经由同时紧密依照其5’UTR来调结这染色体遗传的译文资料。

OCT4与互作蛋白酶功能于当地翻译开始和结束的调节

为了能让更明确地检测组织体内部质中的OCT4互作蛋清，调查工作员对组织体内部质蛋清做好了温和性的裂解，并省略了裂解缓解液中修改核酸酶。这款條件不仅能操作了蛋清/核酸相护功效，还使核质TFs与遗传基因遗传组DNA共沉淀出的，而使相对的含有了组织体内部质蛋清和的可溶解性核质蛋清(如剪接成分)。凭借这款方案，调查工作员可不可以明显能力地下降核质中OCT4转录成分功效的不干扰，并更悉心于其用于RBP的新效果。调查工作员操作质谱枝术检测了2几个OCT4互作蛋清，并定性讲解了因此的亚组织体内部产品定位、分子式效果和分子生物学学流程（图2）。他们蛋清主要的靠近组织体内部核、组织体内部质和组织体内部膜，并具有着翻意成分紧密融合、RNA紧密融合和蛋清紧密融合等效果。STRING蛋清组学网站定性讲解进两步阐明了多OCT4互作蛋清与翻意、转录、的压力发应和轉運等4个组涉及到的（图3）。他们結果证明，OCT4会组织mRNA翻意的调空。在2几个OCT4互作蛋清中，有金典的HNRNPA1和EIF3的组成的这部分EIF3G，这证明OCT4会组织帽信任感于性和/或帽非信任感于性但EIF4F非信任感于性翻意始点流程。小说作家进两步证明OCT4、HNRNPA1和EIF3G会相互组织PI3K/AKT网络信号信号通路遗传基因遗传的帽非信任感于性和/或帽信任感于性但EIF4F非信任感于性翻意始点流程。

图2 OTC4核蛋白互作酚类化合物析

（来源于：Chen, et al., Stem Cell Research & Therapy, 2025）

图3 OTC4球蛋白互作组功能表解析

（出自于：Chen, et al., Stem Cell Research & Therapy, 2025）

OCT4调节作用低氧先决条件下PI3K/AKT信号通路DNA的讲述比列

笔者利用英译组测序和转录组测序研究探讨了低氧生活水平下OCT4在缓解PI3K/AKT移动无线电磁波无线电磁波通道什么是染色体mRNA英译与整体什么是染色体中的功用。笔者优化了英译组和转录组的RPKM动态数据收获了RNA的英译百分率，即总mRNA中的发生英译的mRNA基数。KEGG功能表丰度表明调整英译百分率的什么是染色体最主要是的组织到PI3K/AKT移动无线电磁波无线电磁波通道、mTOR移动无线电磁波无线电磁波通道、胰岛素移动无线电磁波无线电磁波通道、凋亡和腐化体无线电磁波通道等，而上涨英译百分率的什么是染色体最主要是的组织到大多转录細胞、泛素介导的脂肪酸质分解、細胞周期时间和PI3K/AKT移动无线电磁波无线电磁波通道等（图4）。最终结果表明OCT4在氧气不足生活水平下对PI3K/AKT移动无线电磁波无线电磁波通道什么是染色体的英译至关极为重要。OCT4或许利用IRES介导的帽非依赖感性英译有效途径利于PI3K/AKT移动无线电磁波无线电磁波通道什么是染色体的英译。

图4 低氧的条件下的OTC4对血清译文资料的多线程性宏观调控

（原于：Chen, et al., Stem Cell Research & Therapy, 2025）

OCT4激活卡的AKT1译成来克服环世界和阳极氧化应激状态

关键在于进1步探索OCT4与AKT1mRNA配合的制度化，探索者操作HKINT系统（杂合子敲入N端tag标签）敲不光AKT1基因遗传5’UTR的一本分，以毁掉OCT4与AKT1 mRNA的彼此意义。最后意味着，TAP-AKT1核球蛋清质的总体含量面方向取得达不到野山型AKT1核球蛋清质的总体含量面方向，而TAP-AKT1 mRNA的总体含量面方向则取得多于野山型AKT1 mRNA的总体含量面方向，这意味着毁掉OCT4与AKT1 mRNA的彼此意义会调控TAP-AKT1的译成。在星球基地症状经济水平下，野山型AKT1核球蛋清质的总体含量面方向在星球基地症状办理后8H取得身高，然而在24H后医治到原的总体含量面方向。而TAP-AKT1核球蛋清质的总体含量面方向则在一整个星球基地症状当天持续性降低。TAP-AKT1组织比野山型组织更简易 差异性为外胚层和内胚层，但不简易 差异性为间充质。总而言之，OCT4能够 IRES介导的手段解锁AKT1的译成，而在星球基地症状经济水平下维系PSCs的能活和自我管理更新系统效率。

PART.2

散文个人总结

上述情况所论，本论述得知OCT4是物种进化能开干受损细胞中的一项RNA搭配蛋清，它搭配到mRNAs的5’-UTR、3’-UTR和CDS区域环境。在OCT4蛋清质充分效应组中检测工具到二个之比参与者IRES介导讲述起止的蛋清质，搭配RNC-seq/RNA-seq深入分析进每一步核对了OCT4在PSCs积极地响应环世界经济压力的讲述国家宏观调控中的最为关键的效应。指的注意事项的是，OCT4在环世界环境下根据IRES介导经由搭配到AKT1和二个PI3K/AKT数据信息径路基因组mRNAs的GC-rich零件上，并可以淡化什么和什么的讲述起止。根据HKINT方式方法特异形受损AKT1 mRNA的5’-UTR的结构和OCT4-5’-UTR充分效应为显著大幅度降低了AKT1的讲述程度，引发PSCs对脱色应激反应引发的凋亡枯死更是为敏感度，并先行向外胚层和内胚层分解。

PART.3

拜谱总结

本研究通过多组学技术揭示了OCT4作为一种新型的抗应激RNA结合蛋白，在应激条件下通过翻译调控促进多能干细胞的存活和自我更新。OCT4通过结合到AKT1等PI3K/AKT通路基因mRNA的5'-UTR区域，促进其在应激条件下的翻译起始，从而在PSCs的存活和分化中发挥关键作用。拜谱生物为该研究提供了核蛋白互作组质谱分折水平，拜谱生物体可提供了成熟稳定建全的转录组学、蛋白酶组学、代谢转化组学甚至几组学整合安全服务技术设备安全服务网络体系，助力发表高分文献，欢迎致电咨询！

参考使用学术论文：

Chen W, Chen X, Chen C, et al. OCT4 translationally promotes AKT signaling as an RNA-binding protein in stressed pluripotent stem cells. Stem Cell Res Ther. 2025;16(1):84. Published 2025 Feb 23. doi:10.1186/s13287-025-04229-1